Équipe pluridisciplinaire s’intéressant à l'étude des processus morphodynamiques à différentes échelles, pour décrypter des processus normaux ou pathologiques et proposer des stratégies pour la mise en place d’approches diagnostiques et thérapeutiques (cancer, pathologies cardiovasculaires).
Les recherches de DyCTIM2 s’appuient sur un socle commun d’approches théoriques et expérimentales qui sont développées en interaction selon trois thèmes complémentaires :
- Biologie intégrative de la division et de la migration cellulaire, basée sur proposition de modèles mathématiques utilisant les outils de la biologie computationnelle et validés à chaque étape par une confrontation étroite avec un corpus de données expérimentales pertinentes.
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Morphodynamique tissulaire et mécanobiologie : du normal au pathologique, développée autour d’une approche biomécanique de l‘organisation dynamique des tissus qui explicite les relations structure-fonction contrôlées par des facteurs mécaniques, avec des visées d‘applications cliniques.
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Imagerie quantitative cellulaire et tissulaire, axée sur le développement d'approches innovantes en imagerie quantitative et en microscopie fonctionnelle du vivant et utilisant la microscopie optique, l'imagerie par ultrasons et la microscopie par force atomique.
Les recherches qui seront effectuées s'intéressent à l'étude des processus morphodynamiques de l'échelle subcellulaire à l'échelle tissulaire, avec pour objectif de décrypter des processus normaux ou pathologiques et de proposer des stratégies pour la mise en place d'approches diagnostiques et thérapeutiques (cancer, pathologies cardiovasculaires). Ces travaux seront effectués
- au travers des modèles biologiques suivants :
- au niveau moléculaire : auto-organisation spontanée des microtubules (diffusion anomale)
- au niveau cellulaire : interaction cellule-fibre, colonisation tissulaire et cicatrisation, dynamique cellulaire (cycle cellulaire, prolifération et motilité), tubulogenèse (angiogenèse et canaux mammaires)
- au niveau tissus et organes : prolifération et invasion tumorale. croissance de la plaque d’athérome, développement et organisation du myocarde ventriculaire
- et enfin au niveau populations : criticalité auto-organisée en épidémiologie
- au travers des axes de recherches suivants :
- Stratégie thérapeutique assistée par ordinateur pour le traitement du cancer (A. Stéphanou)
- Biomécanique de la plaque d'athérome pour la prévention des accidents vasculaires (].Ohayon)
- Etude des phénomènes de transport moléculaire et de diffusion anomales dans la cellule (N. Glade)
- Modélisation de la croissance tissulaire normale et cancéreuse (A. Chauvière)
- Topologie, phénotypage et modélisation de la croissance du myocarde ventriculaire normal et pathologique (P.-S. Jouk, Y. Usson)
Collaborations universitaires
- Sur le site Grenoblois: AGIM, Clinatec, INRA - LPCV, CEA, GIN, GIPSA-Lab, IAB, LBFA, LIPhy. LMGP
- A l’échelon national : IRI Lille, Créatis Lyon, LABSTIC Brest,Service d'Hémodynamique et de Cardiologie Interventionnelle, Hôpital Cardiologique Louis Pradel Lyon
Collaborations internationales
- Department of Mathematics, University of Sussex, UK
- LBUM - Laboratoire de Biorhéologie et d’Ultrasonographie Médicale,Centre Hospitalier de l’Université de Montréal (CHUM), Montréal - Québec-Canada
- Lester and Sue Smith Breast Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA
- NIBIB—NIH, Bethesda, USA
Projets INSERM financés
- INSERM Plan Cancer Biologie des Systèmes, 2013-2015
- INSERM Plan Cancer Physique, Mathématique, 2018 SWIR 2018-2020
Projets ANR financés
- ANR blanche MOLSYBEN 2007-2010
- ANR blanche SYBECAR 2011-2013
- ANR IMOXY 2012-2015
- ANR MOSIFAH 2013-2018
Nos contrats et programmes de recherche :
- FUI 2017 INOVOLINE : 2018-2020
Subvention FRM Cytosquelette
Subvention INSERM
Convention IKKI/CNRS
Responsable(s)
- Yves USSON (Chercheur)
Permanents
- Arnaud Chauviere (Enseignant chercheur)
- Ibrahim Cheddadi (Enseignant chercheur)
- Arnold Fertin (IT-BIATSS)
- Nicolas Glade (Enseignant chercheur)
- Pierre-Simon Jouk (Enseignant chercheur)
- Angélique Stephanou (Chercheur)
- Yves Usson (Chercheur)
- Boudewijn Van Der Sanden (Chercheur)
Autres
- Abderhaman Cheniour (IT-BIATSS)
- Irène Garcia-Ferrer (Chercheur contractuel)
- Ian Manifacier (Chercheur contractuel)
- Walid bertal (Stagiaire)
Doctorants
- Pierre Jacquet (Doctorant)
- Rémi Segretain (Doctorant)
- Nathan Shourick (Doctorant)
- Kevin Spinicci (Doctorant)
- Alaa Tafech (Doctorant)
Les thèses en cours dans notre équipe :
- Pierre Jacquet : "Apport à la compréhension du métabolisme tumoral par la modélisation et validation quantitative à partir de l'imagerie 3D de sphéroïdes tumoraux issus de gliomes. " (encadrée par Angélique Stephanou )
- Rémi Segretain : "Projet Atavisme - Inférence de réseau Booléens à signes par programmation logique par contrainte pour modéliser l'homéostasie cellulaire et tester la théorie ataviste du cancer " (encadrée par Nicolas Glade )
- Nathan Shourick : "Modélisation mathématique et numérique du mouvement collectif dans les épithéliums " (encadrée par SARAMITO Pierre (LJK) , GRANER François (MSC Paris) , Ibrahim Cheddadi )
- Kevin Spinicci : "Approches computationnelles et mathématiques pour la compréhension de la reprogrammation du métabolisme des cellules tumorales et conséquences pour l'optimisation thérapeutique " (encadrée par Angélique Stephanou , POWATHIL Gibin )
- Alaa Tafech : "Développement de méthodes - sur sphéroïdes tumoraux in vitro - pour la mesure de paramètres bio-physiologiques associés à l'évolution tumorale et à des fins d'optimisation thérapeutique par une approche couplée de modélisation et d'imagerie " (encadrée par Angélique Stephanou )
Plateforme d' Imagerie Cellulaire et Tissulaire
Spécificité : Développement de traitement et analyse d’images pour la microscopie Localisation : |
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Responsable scientifique : Yves Usson
Liste des équipements :
- Microscope Confocal à balayage laser Zeiss LSM710 avec chambre thermostatée et CO2
- Microscope à Force Atomique (AFM) en phase liquide
- Microscope Holographique Numérique Lyncéetech (avec épifluorescence)
- Microscope de Bioluminescence
- Station de Vidéo-microscopie (épi-fluoresnce) automatisée pour suivi de longue durée
- Microscope de Tomographie Optique Cohérente (OCT)
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Réservation des machines : resa-ictiss.imag.fr