Equipe Génomique et évolution des microorganismes

L’adaptation des organismes vivants à divers stress et environnements résulte de modifications génétiques et de la restructuration des réseaux de régulation et métaboliques. Notre équipe travaille principalement à comprendre et quantifier ce potentiel adaptatif chez les bactéries et, plus généralement, à caractériser les mécanismes moléculaires et écologiques de l’évolution. Nous cherchons à établir le lien, mais aussi sa plasticité évolutive, entre modifications génétiques/génomiques et changements phénotypiques liés à certaines fonctions biologiques, dont certaines sont directement associées à des problèmes de santé publique (virulence, résistance aux antibiotiques). Nous utilisons également l’information obtenue suite à l’étude de l’évolution passée et présente des bactéries pour révéler des mécanismes fondamentaux de leur fonctionnement. Notre objectif est ainsi de développer une biologie des systèmes évolutive qui s’inspire et rende compte des propriétés des microorganismes, de leurs capacités d’innovation (évolvabilité) et de résilience (robustesse).

Nos approches sont interdisciplinaires. Elles combinent évolution expérimentale, biologie cellulaire, génétique, biochimie, génomique comparative et modélisation biophysique.

Trois thèmes sont actuellement développés :

  • Évolution expérimentale au long terme des bactéries (Responsable Dominique Schneider)
  • Mécanismes de biosynthèse et d’évolution de l’ubiquinone (Responsable Fabien Pierrel)
  • Implication de l’organisation des génomes et de la structure physique de l’ADN sur la co-régulation des gènes (Responsable Ivan Junier)


L’équipe :

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De gauche à droite : Otmane Lamrabet (Post-doc), Mickael Martin (Technicien UGA), Amélie Amblard (Technicien UGA), Thibaut Lepage (Post-doc), Laurie-Anne Payet (Post-doct), Jérémy Curot (Doctorant), Dominique Schneider (Professeur), Joël Gaffé (Maître de Conférences), Antonia Suau-Pernet (Professeur), Fabien Pierrel (CR), Ludovic Pelosi (Maître de Conférences), Ivan Junier (CR), Thomas Hindré (Maître de Conférences), Jessika Consuegra (Doctorante), Corinne Mercier (Maître de Conférences, absent).


Laboratoire TIMC-IMAG, Domaine de la Merci, 38706 La Tronche Cedex

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